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FAD 的病理、表现和进展与更常见的散发性晚发性阿尔茨海默病非常相似,FAD 主要遗传的单基因性质表明,阐明致病机制应该更容易。由于显性错义 FAD 突变仅在底物和产生 Aβ 的酶中发现,这些突变都可能导致 γ-分泌酶对 APP 底物的蛋白水解过程发生改变。然而,这一过程是复杂的,APP 跨膜结构域 (TMD) 被膜内嵌入的 γ-分泌酶复合体多次切割,沿着 Aβ49→Aβ46→Aβ43→Aβ40 和 Aβ48→Aβ45→Aβ42→Aβ38 两条途径产生 Aβ 肽。研究人员对 APP TMD 中 14 个 FAD 突变,对这些蛋白水解事件的影响的综合分析,发现每个突变在第一或第二羧基肽酶修剪步骤中都存在缺陷,升高了 Aβ45 或更长时间的 Aβ 肽水平。这种完整和定量的分析尚未报道任何早老素 FAD 突变。